一个国际为首的St. Jude儿童医院的研究人员的研究小组已经发现了一种新的细节，急性淋巴细胞白血病（ALL）高危亚型以及可能的靶向治疗。这些发现发表在今天的自然通讯科学杂志上。
亚型的特征是染色体重排，涉及MEF2D基因和六的合作伙伴基因，最常见的基因治疗新靶点。它被称为后重新安排一切。
“后是一种转录因子，交换机上的其它基因的表达在正常的发展过程中，相应的作者Charles Mullighan、M.D.、学士说，圣裘德病理区的一员。“我们发现，细胞染色体重排扰乱这些基因的表达和创造一个漏洞，至少一个靶向治疗药物帕比司他。”
1700多名儿童的基因组分析，青少年和成年人都确定了42个与MEF2D重排。研究人员计算，能够重新安排，所有病例的遗传基础是未知的几乎所有账户百分之30百分之5.3。MEF2D重排亚型最经常发生在青少年和降低与生存相比其他所有亚型相关。
帕比司他能抑制蛋白家族包括HDAC9的活动。研究人员表明mef2d重排的白血病细胞产生高水平的HDAC9。研究人员测试了帕比司他在实验室发现药物停止对人类白血病细胞增殖后重新排列。
帕比司他和类似的药物是已知的具有广泛的抗肿瘤活性，目前正在对不同类型的白血病和淋巴瘤的治疗试验。Mullighan说，白血病细胞后重新帕比司他极其敏感，提示该药可能功能更加有针对性地对细胞的重排。
“如果帕比司他进一步测试，单独或联合治疗，证实了抗增殖活性，为患者的临床试验的基础上，特别是那些有高危疾病或复发的患者，”他说。
在这项研究中，研究人员对560名患者的RNA进行测序，以发现基因变化，尤其是驱动肿瘤生长的染色体重排。1164例RNA测序结果证实。
两例还进行了全基因组测序（WGS）。该研究的DNA序列编码的完整生命所需要的指令。RNA测序提供了一个快照，其中的基因组中的基因表达和表达水平。这下一代测序方法特别适用于鉴定新的基因重排，包括融合基因时创建的块断保险丝时，基因的染色体断裂和重组。
本研究使用的样本来自美国的白血病患者，加拿大和欧洲，包括联邦政府资助的儿童肿瘤学组（COG）和其他八个机构和研究社。参与研究的美国国家癌症研究所的治疗应用研究合作产生有效的治疗（目标）的倡议。目标使用COG样品的基因组分析来确定治疗目标和促进发展为儿童癌症治疗更有效。
“在过去的十年中我们了解到，导致开发的所有遗传变化很大，”合著者Stephen Hunger，说M.D.的儿童医院和费城宾夕法尼亚大学医学院，对目标/ COG所有项目主任。然而，正如这项研究所显示的那样，我们继续确定白血病细胞中特定的遗传改变所定义的新子集，这些基因常常为治疗结果提供重要信息，并为精确的药物治疗确定新的策略。
此外患者的细胞重排的亚型，研究人员还发现了20例染色体重排，涉及znf384基因和六个不同的合作伙伴基因。两例MEF2D和znf384重排有不同的基因表达模式，表明融合的每种类型的所有关键驱动因素。
研究人员还发现融合蛋白从细胞重排导致在实验室小鼠细胞持续生长比较正常的细胞或其他蛋白质所造成的。“这表明mef2d融合在有限的寿命为白血病细胞，是不朽的转化正常白细胞的关键一步，”Mullighan说。
实验室和临床研究结果确定了其他的区别。例如，所有发生在3岁到5岁之间的儿童。用后患者平均重排在本研究的14。5年无癌生存率为MEF2D重排所有患者为百分之71.6。这是优于一些高风险的所有亚型，但它落后于百分之87.3的其他某些高危亚型患者。
赵慧谷，博士，圣裘德博士后，是第一作者。其他作者代表28个医疗中心，大学和其他组织在美国，加拿大，欧洲和以色列。

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