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无细胞DNA可能是监测尿路感染的关键

根据康奈尔大学Meinig生物医学工程学院和NewYork-Presbyterian的Weill Cornell Medicine研究人员的最新研究,测试尿路感染的新方法比传统方法提供的信息更多。

在6月20日发表在Nature Communications上的一项研究中,研究人员分析了从肾移植患者的尿液中分离出的称为无细胞DNA的DNA片段。他们发现这种DNA提供了有关患者尿液中细菌和病毒组成的有价值信息。

临床医生经常用尿培养检测尿路感染,尿培养涉及细菌滋生。“但是有些细菌比其他细菌更难生长,对于传统技术,你必须选择一套特定的测试来检测特定的细菌,”共同主要作者,威尔康奈尔大学医学助理教授John Richard Lee博士说。纽约长老会/威尔康奈尔医学中心的医学和肾脏科医生。“这项使用无尿细胞DNA的测试偏差较小,因为它可以广泛筛查不同类型的感染,包括常见和罕见的感染。”

无尿细胞DNA(cfDNA)是DNA的漂浮分子,其源自垂死的人或微生物细胞的基因组。它们通常在血浆中研究,但也存在于尿液中。

调查人员分析了在NewYork-Presbyterian / Weill Cornell医疗中心接受护理的82名肾移植受者的尿液样本。通过观察这些患者的尿液cfDNA,研究人员不仅确定了传统方法检测到的相同微生物,还鉴定了其他不太常见的微生物。通过仔细查看基因组结构,他们还能够了解宿主对感染的反应以及细菌生长的速度。

“通过一次测试,可以同时确定有关细菌和病毒以及抗生素抗性的许多信息,”共同主要作者,康奈尔伊萨卡生物医学工程助理教授Iwijn De Vlaminck博士说。校园。

cfDNA片段短而且片段化,这使得使用DNA测序方法分析更加困难。然而,通过优化cfDNA片段分析,在该研究中仅需要1ml离心的尿液。

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