研究人员:您需要数据分析方面的帮助吗?寻找精密医学项目的合作者?
PMedIC 于今年早些时候启动, 旨在加强OHSU与美国能源部位于华盛顿州里奇兰的太平洋西北国家实验室之间的研究合作。
OHSU-PNNL精准医学联合实验室(PMedIC)邀请研究界参加9月27日星期四在胡德河举行的为期一天的数据科学务虚会和头脑风暴会议。
撤退的目标是将正在开发新型分析和工具的科学家与正在从事精密医学项目的人员聚集在一起。
“在撤退时,你将能够推销你的工作,找到合作者,并了解PNNL的先进分析能力,” OHSU医学院基础研究副主任Mary Heinricher博士说。
如果您有兴趣参加或想了解更多信息,请 发送电子邮件给 OHSU医学院战略合作伙伴关系主任Aditi Martin。请在8月3日星期五之前回复。
数据科学撤退议程草案
抵达,登记和点心9-9:30
上午9:30-10概述和机会
10-11:10 am最多12个五分钟的闪光讲座 - OHSU调查员
11:10-11:20休息
11:20-12:30 pm最多12个五分钟的闪光讲座 - PNNL调查员
下午12:30-1:1工作午餐:flashtalks,Q&A
下午1-2点并行工作组讨论,包括但不限于
找出差距和挑战
EM /成像数据组和Omics数据组
2-2:30 pm工作组报告和讨论
下午2:30-2:45休息
2:45-4 pm改革工作组 - 解决方案的战略
下午4-4:30从工作组报告未来方向
上午的会议将概述PMedIC以及与刚刚发布的NIH数据科学战略计划相一致的已知机会。
下午的会议将分为并行工作组,主题包括但不限于a)机器学习/深度学习应用于成像数据和b)路径分析和'组学数据的整合。
第一个下午的会议将侧重于确定挑战和知识差距,然后进行整个小组讨论。第二个下午的会议将向参与者收取优先顺序,优先考虑OHSU和PNNL的综合能力将提供竞争优势的两个挑战,并在高层次上简要概述应对这些挑战的方法。
关于PMedIC的更新
PMedIC 于今年早些时候启动,旨在加强OHSU与美国能源部位于华盛顿州里奇兰的太平洋西北国家实验室之间的研究合作.PMedIC促进创新分析技术在三大支柱中的协同应用 - 数据科学,成像和组学分析 -推进精准医学的科学与实践。
“这三大支柱中的每一支都已经组建了一个初始的领导团队,并且在获得外部资金方面取得了很大的早期成功,” PMEDIC联合主任Karin Rodland博士说道,他是PNNL的实验室研究员和附属教授。细胞,发育和癌症生物学,OHSU医学院。
成像
PMedIC在成像方面的优势涵盖多种尺度,从近原子分辨率结构图像(cryoEM)到3D细胞和亚细胞结构(循环IF)到器官系统(CT和MRI)。
在太平洋西北地区CryoEM中心的资助下,OHSU和PNNL的电子显微镜小组已经开始建立该中心,并为OHSU的cryoEM未来奠定了基础。
将深度学习应用于用于分析恶病质的CT图像的分割和量化的额外努力正在进行中。
“组学
多年来,PNNL和OHSU合作将先进的蛋白质组学技术应用于生物医学问题。
为了扩大蛋白质组学相互作用的范围,今年早些时候举办了一个研讨会,PNNL的组成团队的多名成员向OHSU对'组学项目感兴趣的教师介绍了质谱的最新创新,重点是CEDAR科学家。OHSU的组学教师参加并介绍了OHSU的能力。
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