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短肠综合征导致基因表达改变

由Tracy C. Grikscheit博士领导的洛杉矶儿童医院的研究人员使用斑马鱼新模型和进行强化基因测序,绘制了由短肠综合征(SBS)引起的遗传变化。这种确定SBS中哪些基因显着过表达或者表达不足的方法可能有助于科学家开发将来治疗这种疾病的儿童和成人的治疗方法。研究结果发表在BioMed Central Genomics上。

早产儿的坏死性小肠结肠炎,小孩和成人的克隆氏病和创伤可能需要清除CHLA-3D渲染 -   -  DNA.jpg的SBS中大量的小肠,并且由于小肠长度不足,身体不能从食物中吸收营养。在儿童中,SBS的发病率几乎是儿童癌症的两倍,手术后5年的死亡率约为30%。到目前为止,与SBS相关的发病率和死亡率与静脉营养品的营养不良和肝纤维化有关。在这项研究中,研究人员试图确定仅由疾病过程引起的全身性影响。

研究小组使用在Grikscheit实验室中创建的经过验证的SBS模型在斑马鱼中进行了这项研究。这个模型允许研究者研究来自斑马鱼肠道手术的小肠和接受“假手术”或控制手术的小肠的匹配样品。根据第一作者Kathy A. Schall医学博士的说法,“大多数SBS的研究都集中在肠道上皮细胞上,但是这个模型使我们能够关注全身性的影响以及相关的遗传改变。

该报告报道,29条鱼进行了肠道手术,而28条鱼接受了假手术。在两周之前,确定与最大干细胞和祖细胞活性相关的时间之后,进行RNA测序分析。与假手术对照相比,具有SBS的斑马鱼具有1346个显着上调的基因和678个显着下调的基因。上调的基因与包括细胞增殖,急性期反应信号传导,先天性和适应性免疫,胆汁酸调节,一氧化氮和活性氧的产生,细胞屏障维持和凝血的过程有关。下调的基因与叶酸合成,糖原异生,糖原分解,脂肪酸氧化和活化以及药物和类固醇代谢有关。

“我们已经发现了几种代谢途径的显着变化 - 包括以前被认为是静脉营养效应的一些代谢途径,”Grikscheit说。他也是南加州大学Keck医学院的外科副教授。“知道这些改变是由于缺乏静脉营养的SBS引起的,为我们开发新疗法以改变这些效果提供了多个目标。我们现在没有在随机的地方挖掘,而是在寻找治疗SBS的方法。“Grikscheit补充说,仅需10%的需要家庭静脉营养SBS的美国病人就可以节约近800美元百万的医疗保健费用。

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