大肠癌的基因预测的免疫系统来对抗肿瘤的能力，研究表明-达纳法伯癌症研究所

大肠癌肿瘤相关蛋白的大量装饰着称的新抗原可能渗透着抵抗疾病的白细胞，在达纳-法伯癌症研究所的一项新的研究 和广阔的哈佛和麻省理工学院研究人员报告。因为这样一种白血细胞的大量涌入往往意味着对癌症的免疫系统攻击，发现将加强研究，使肿瘤更容易受到这样的攻击。

这一发现在今天的一项研究中被发表在杂志上细胞报告。这是由两个大的健康跟踪研究，护士的健康研究和健康专业人员跟踪研究的患者的几个数据集。研究人员首先进行了全基因组测序对结直肠肿瘤标本619例，–列的每一个字母的DNA，指定如何细胞蛋白是构建。这个信息是由免疫系统对肿瘤的反应测试数据和病人的临床数据合并，包括生存的长度。       

“我们正在寻找的遗传特征，预测了广泛的肿瘤浸润的淋巴细胞白血细胞[一定]这类淋巴细胞的存在，”研究的共同作者，马里奥Giannakis，MD，PhD说，在Dana法伯胃肠道肿瘤治疗中心医学肿瘤学家和临床研究员，在麻省理工学院哈佛Broad研究所研究员。“我们发现肿瘤抗原负载的高–携带大量的新抗原–往往是由大量的淋巴细胞浸润，包括记忆性T细胞，为防止以前遇到的感染和疾病。患者的肿瘤有高数量的新抗原的存活率也比低抗原负载长。”

新抗原变异形式的蛋白质抗原，而在正常细胞中发现的。基因突变导致癌细胞产生异常蛋白，其中一些被抬到细胞表面，在那里他们作为红旗的免疫系统有毛病         细胞。

“可以有成百上千的新抗原的肿瘤细胞，“Giannakis解释。“只有少数几个可能真正引起细胞浸润肿瘤。但更多的新抗原的展示，更大的机会，他们中的一些会引发免疫系统的反应。”

被称为免疫检查点抑制剂的治疗方法，通过清除免疫系统攻击癌症的一些障碍。虽然这些药物在某些情况下已经取得了惊人的结果，但它们通常只对免疫系统已经对癌症免疫反应的患者有效。通过显示高抗原负载的肿瘤很容易被细胞内的细胞系的，因此，这项研究可能有助于研究者确定哪些患者最有可能受益于新的临床试验的免疫检查点抑制剂。

这项研究的大肠癌样本的基因组分析，也发现了几个经常突变的基因，以前没有强烈相关的疾病，包括bcl9l，rbm10，CTCF，and KLF5。在大肠癌的患病率研究表明他们可能对新疗法的重要目标。        

“我们的研究有助于揭示大肠癌的整体发展，“Giannakis说。“这也显示了通过将分子研究与其他领域如流行病学和免疫学的研究结果相结合的见解。”

The other co-lead authors of the study are Xinmeng Jasmine Mu，PhD，and Sachet A. Shukla，PhD，of Dana-Farber and the Broad Institute.  The senior authors are Levi A. Garraway，MD，PhD，and Catherine Wu，MD，of Dana-Farber，Brigham and Women’s Hospital (BWH)，and the Broad Institute，Charles S. Fuchs，MD，MPH, of Dana-Farber and BWH，and Shuji Ogino，MD，PhD，of Dana-Farber，BWH，and Harvard T.H. Chan School of Public Health.  Co-authors are Zhi Rong Qian，MD，PhD，Mai Yamauchi，Kosuke Mima，MD，PhD，and Kentaro Inamura of Dana-Farber; Ofir Cohen and Ali Amin-Mansour，of Dana-Farber and the Broad Institute; Kimmie Ng，MD，MPH，and Jeffrey A. Meyerhardt，MD，MPH，of Dana-Farber and BWH; Eliezer M. Van Allen，MD，of Dana-Farber，BWH，and the Broad Institute; Reiko Nishihara，PhD，of Dana-Farber and Harvard T.H. Chan School of Public Health; Samira Bahl，PhD，Chip Stewart，PhD，Mara Rosenberg，Michael S. Lawrence，and Stacey B. Gabriel，PhD，of the Broad Institute; Gad Getz，PhD，of the Broad Institute and Massachusetts General Hospital; Eric S. Lander，PhD，of the Broad Institute，Massachusetts Institute of Technology，and Harvard Medical School; Edward L. Giovannucci，MD，ScD，of Harvard T.H. Chan School of Public Health and BWH; Yin Cao，MPH，DSc，of Harvard T.H. Chan School of Public Health，Harvard Medical School，and Massachusetts General Hospital; Yasutaka Sukawa，of Keio University，Tokyo，Japan; Katsuhiko Nosho，of Sapporo Medical University，Sapporo，Japan; Jonathan A. Nowak，MD，PhD，of BWH; and Andrew T. Chan，MD，MPH，of Massachusetts General Hospital，and BWH.

Support for the study was provided by a KL2/Catalyst Medical Research Investigator Training award from Harvard Catalyst/The Harvard Clinical and Translational Science Center (National Center for Research Resources and the National Center for Advancing Translational Sciences，National Institutes of Health Award KL2 TR001100); the Dana-Farber Cancer Institute Leadership Council; the 2014 Colon Cancer Alliance-AACR Fellowship for Biomarker Research (Grant Number 14-40-40-GIAN); the Perry S. Levy Endowed Fellowship; the Project P Fund; the Blavatnik Family Foundation; the Friends of the Dana-Farber Cancer Institute; and the National Institute of Health (grants U54 HG003067，K07 CA190673，K07 CA148894，K24 DK098311，R01 CA137178，R01 CA155010，P01 CA87969，UM1 CA186107，P01 CA55075，UM1 CA167552，R01 CA151993，R35 CA197735，R01 CA118553，R01 CA168141，and P50 CA127003).

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