国际开放阅读框架的集合现在的人类蛋白编码基因百分之80、协作报告-达纳法伯癌症研究所

一个国际组织的合作，包括达纳法伯癌症研究所，在创造一个图书馆对人类细胞中不同蛋白质的成千上万的完整基因图谱达到了一个里程碑。组成的开放阅读框（ORF），收集–部分基因编码全长蛋白–是科学家人类细胞的基本力学和这些过程如何走歪在疾病研究的重要资源。

在今天发表的一篇论文中自然方法的合作，进行（OC），一组13个学术、商业和政府组织，宣布其ORF克隆集合现在包括人类细胞中所有的蛋白质编码基因的百分之80–在所有17154个，和计数。它是世界上最大的人类基因集合，公开提供给全世界的研究团体。

“OC ORF集合可以在广泛的研究应用的巨大效用，”文章的资深作者说，戴维E.山，博士，在癌症系统生物学中心副主任（CCSB）在Dana法伯，一对OC的创始机构。“以一种全面的方式探索细胞生理学，科学家需要一种资源，使他们能够表达几乎任何细胞蛋白的兴趣。OC是那种工作一个独特的和有价值的工具。”

成千上万的科学家用OC提供ORF克隆在自研的合作始于2005。应用包括蛋白质-蛋白质相互作用的大规模的映射；重组人蛋白生产；特定蛋白质功能筛选；疾病特异性蛋白质相互作用网络的发展；对击倒或敲除的关键蛋白在细胞的影响的研究，和其他用途。

克隆人以最小的成本可以从世界各地的经销商多OC，无限制的使用OC。在合作和订购克隆信息可以在OC网站：www.orfeomecollaboration.org。

“这个网站也有一个可搜索的数据库，我们提供丰富的注释和克隆编码蛋白提高社区利用，”斯特凡说维曼，博士，德国癌症研究中心的（DKFZ），海德堡，德国，该研究的第一作者。

每个框包含一个特定基因的蛋白质编码区。ORF克隆在质粒包裹，注入细菌和存储在OC的多分布在冰柜中。克隆是在网关ä矢量格式提供，它允许使用例如表达相应的蛋白质种类繁多，载体易转移大肠杆菌，酵母和哺乳动物细胞中，甚至无细胞表达系统。

OC长大的人进行非正式的讨论会议由CCSB达纳法伯在本世纪初的研究人员之一。”来自各个机构的与会者开始讨论他们在发生区和验证码做，”希尔解释。“我们开始思考我们如何能够共同生产出最大可能的收集。”

“OC不同成员在其操作表演不同的角色，”希尔继续。“一些团体一直在添加新的克隆的集合，有的做DNA测序，或集中在编码质量控制和归档他们的成员。有些做信息工作，而其他人主要是参与分配。达到目前的里程碑，需要一个非常不同的人和组织的共同努力。每个人都参与了一个重要的贡献，这使得这是一个非常愉快和高效的合作。”

这个相位代表的是“结束的开始”的OC成员继续共同努力，扩大人类的进行以及添加ORFeomes其他模式生物。

这项研究的联合作者：克里斯塔Pennacchio劳伦斯Livermore国家实验室；哈佛医学院临湖；普雷斯顿猎人，进公园，凯瑟琳赛，杰森钢，和约书亚labaer亚利桑那州国家大学；马蒂亚斯哈伯的dnaform Inc.和理化学研究所横滨研究院、神奈川两，日本；亚历山德拉埃米特和Anja Van Brabant史密斯的一部分dharmacon，GE医疗，拉斐特，科罗拉多州；格雷姆伯特利的韦尔科姆基金会桑格研究所，剑桥，英国；梅兰妮Busse和汤姆源生物科技、诺丁汉、英国carninci织布；皮耶罗，荣hayashizaki，和卡瓦依君，理化学研究所横滨研究所；加利福尼亚大学圣克鲁斯标志，diekhans；伊恩Dunham威康信托公司更多的研究所；佟浩，Kourosh萨利希‐蒂亚，和Marc Vidal，博士，达纳法伯；·韦德哈珀达纳法伯哈佛癌症中心；奥利弗万岁，艾格尼丝霍茨wagenblatt，阿尼哥Jöcker，和鲁思wellenreuther德国癌症研究中心；斯特芬Hennig，克里斯托夫Koenig，和Johannes毛瑞尔日图片GmbH，柏林德国；wonhee璋和瓦格纳，美国国立医学图书馆、美国国立卫生研究院（NIH），贝塞斯达，马里兰州；伯恩哈德光辉的ressourcenzentrum FüR genomforschung ggmbh克力斯汀兰伯特，柏林，德国；和国家人类基因组研究所，国立卫生研究院的加里庙；安妮塔Lebeau，生物技术中，亨茨维尔hudsonalpha，阿拉巴马州的研究所；genecopoeia，Inc.，罗克维尔孙露，马里兰州和广州fulengen，公司G广东，中国；特洛伊穆尔开放的生物系统，Inc.，亨茨维尔，阿拉巴马州；小寒2006 kasusa DNA研究所，木更津，千叶，日本；安德烈亚斯rolfs哈佛医学院；布莱克西蒙斯hudsonalpha生物技术和开放的生物系统，研究公司；尾阳genecopoeia，Inc.，罗克维尔，马里兰州；达妮埃拉美国格哈德国家癌症研究所，国立卫生研究院。

这项研究由波士顿的埃里森基础，资金支持，和达纳法伯癌症研究所资助的研究经费和研究经费，从教育部的文化、体育、科学和技术，日本的理研组学科学中心和理化学研究所生命科学技术中心。德国的基因联盟是由联邦教育部资助的德国基因组计划和国家基因组研究网络计划的框架。

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