扫描近5000个肿瘤样本的DNA,所带领的团队在达纳-法伯癌症研究所的科学家和Broad研究所已经确定了140个地区的炒遗传密码认为含有很多未被发现的癌基因。
研究人员说,异常区域的映射给出了癌症科学家一个起点,寻找尚未被发现的癌基因和抑癌基因的破坏,使细胞分裂和生长失控。发表于十月发行的自然遗传学,结果是一个正在进行的国际研究工作的一部分,以确定基因突变的景观和其他基因变化,燃料的发展癌症。
作者说,这是迄今为止最大的分析,在几种类型的癌症基因“拷贝数变化的作用”。正常细胞携带20000个基因组成的基因组。癌细胞的基因组通常是充满了地方的遗传序列复制或删除;事实上,拷贝数变化的影响更多的癌症基因组比其他DNA异常。这项研究的目标是确定拷贝数的改变模式,并确定它们如何促进癌症。
在4934种癌症的11种类型的调查,我们发现癌症往往经历整个基因组加倍,随后大量较小的拷贝数变化的事件,说:”rameen Beroukhim,MD,PhD,达纳法伯医学助理教授和Broad研究所的会员。”我们也看到了一个倾向的拷贝数的变化发生在端粒[染色体的提示],他们表现出的特点,表明他们来自不同的机制比在染色体内的区域的拷贝数变化。
Beroukhim共同随着Matthew Meyerson博士,医学博士,该报告的资深作者,达纳法伯和宽,和GAD Getz,博士,美国马萨诸塞州总医院和广阔的。
分析还揭示了癌症基因组进行复制-也被称为扩增-更多的机会往往比预期的要和70个区域包含的缺失往往比预期的机会70区域。”我们预计这140个区域包含一些未知的癌基因和抑癌基因,”Beroukhim说。
平均而言,这140个地区包括三至四个基因。然而,只有35的地区包含已知的癌基因或肿瘤抑制基因与癌症相关。所以还有很多要在癌症基因的发现,”Beroukhim说。”这些地区研究界提供一个出发点来评估可能的新的癌基因和抑癌基因。”结果已在可公开访问的网站提供,www.broadinstitute.org\/tcga。
他补充说,研究人员所产生的拷贝数变异数据库的进一步研究“将有助于我们更好地了解癌症的产生和涉及的基因是什么。当我们明白,我们可以开发出诊断和治疗方法来抵消这些基因。”
本研究采用的数据是由美国癌症研究所和国家人类基因组研究所领导的癌症基因组图谱的研究所编制的数据。
共同第一作者的报告是特拉维斯扎克和史提芬舒马赫在Beroukhim实验室在达纳-法伯。
研究资金部分由国立卫生研究院(u24ca143867,u24ca143845,u54ca143798,u54hg003067,和u24ca143882),V基金,和儿童低级别星形细胞瘤的基础。
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