对于热点的染色体重组狩猎

研究地图在染色体后再加入破碎;可以帮助癌症基因组学和努力发展基因治疗指南解读

2011年9月29日

波士顿,大众。& ndash;研究孩子们的医院和免疫疾病研究所(IDI)已经创建了一个映射&ldquo法;热点”在染色体是最有可能打破和重组基因组,知识,帮助定义的规则时,断裂发生。了解这些规则可以改变科学家认为癌症基因组学方面的方式,也有助于指导正在进行的努力,以开发基因治疗为基础的各种条件的治疗。

该研究小组,由Frederick Alt键,博士,在孩子们的IDI和在细胞ular和分子医学项目主任的医院领导;报告中细胞的9月30日发行他们的结果。
在许多癌症,整个染色体得到重新安排或重组,物理破坏和与其他染色体交换部分。这些重排,称为易位,连接两个基因的部分,共同打造新的“融合”的基因,有时结合原对的函数来创建癌基因。
“在过去50年左右的人们一直在表征易位,”Alt键,谁也霍华德休斯医学研究所的研究员和儿科查尔斯A.詹韦教授在哈佛医学院说,“但我们还没有理解机制形成他们。我们知道发生了什么,但不知道如何发生的。
“这项研究,”他继续说,“帮助定义什么这些机制。”
为了更好地underst和支配,其中在基因组断裂发生状语从句,其中一个破碎的一块染色体意志升和的,Alt键和他的同事开发的映射方法,他们称之为“translocatome”的规则 - 总的全基因组的补对于特定染色体断裂重排。的方法中,所谓的高通量全基因组易位测序(HTGTS),是基于DNA的切割酶如I-SceI位,酶的一般类型也正在审查为一体的动作一个可能的基因治疗工具,和这在目前的研究中使用Alt键的球队。
研究小组发现,破碎的染色体片段往往基因的起源附近的融合,在被称为转录起始位点的位置。“在该易位发生在转录起始位点的频率极高,”ALT解释说,“这意味着一些有关转录过程本身可能会鼓励染色体断裂“。
此外,他们还发现,断裂的染色体重排往往在自身,而不是在不同的染色体上分享作品。“我们仍然在定义什么都易位规则,过程”ALT指出,“但我们认为,因为染色体倾向于折叠成球,一个给定的染色体内断头往往在物理上彼此接近,而不是在其他染色体断裂“。
在哪里和规则由易位发生这种更大underst和荷兰国际集团可能会导致想着基因状语从句:常易位如何特别有助于癌症的一种新方法。例如,HTGTS可以帮助科学家找出哪些癌基因可能通过展示有助于不同肿瘤其具有用于容纳在肿瘤祖细胞易位位点的高潜力。
该方法还可以帮助癌症基因组研究人员确定易位在一个特定的肿瘤居然打在肿瘤的生长和存活和作用这是在本质上,无辜byst和ERS。
&Ldquo;儿童癌症,从白血病和淋巴瘤神经元肿瘤,都纷纷表示常表现为易位固有的基因组不稳定性,说:“Alt键”。不过,虽然易位拿出非常频繁跨越癌症基因组,这是这些细胞中选择那些对于那些非常重要的。我们的工作将有助于集中力量underst对那些涉及到肿瘤发生和可能有一定的治疗价值和癌症易位“。
Alt键的研究小组还发现,I-SceI位酶,他们用来创建染色体断裂可以看作数量惊人的整个基因组先前未被承认的位置,这可能会影响这种酶的效用作为基因治疗的一个工具的信息切断DNA。“我们认为,HTGTS可以帮助基因治疗社区和他们正在考虑酶的充分活动更好underst和避免可能出现的脱靶效应,“Alt键说。
这项研究由美国国家癌症研究所,过敏和传染病研究所,霍华德休斯医学研究所,白血病和淋巴瘤协会,和在V基金会的支持。
接触:
艾琳的长跑冠军
波士顿儿童医院
617-919-3110
erin.mccolgan@childrens.harvard.edu
孩子们的医院是家总部设在儿科医疗中心,在那里它的发现既有益于孩子们的世界上最大的研究企业和自1869年1100多名科学家的成年人,其中包括美国国家科学院的九名成员,11名成员医学研究所和霍华德休斯医学研究所的九名成员包括儿童的研究团体建立的一个20张病床的医院为孩子,孩子们的医院;今天是在价值为基础的儿科和青春期保健396床全面中心卓越的复杂需求,病人护理和灵敏度的状语从句:常儿童多样性和家庭的儿童的也是哈佛医学院的主要儿科附属教学医院如欲了解更多有关儿童的研究和临床创新的更多信息,请访问:.. HTTP:// vectorblog。组织。

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