核糖核酸编辑事件的另一种方法来研究生物标志物和治疗靶点
MD安德森新闻稿10 \/ 01 \/ 2015
癌症专家们长期关注基因突变和基因拷贝的改变,以帮助预测患者的生存和药物敏感性。一个由德克萨斯大学MD Anderson癌症中心的研究开辟了另一途径,了解生物的原因,一些人活得更长或更好地应对处理–RNA编辑事件。
从癌症基因组图谱的17个不同类型的癌症患者的6226个样本的评估显示新的信息,在肿瘤与正常组织的核酸编辑事件,并提供证据表明,核酸编辑可以选择性地影响药物的敏感性。核糖核酸的编辑是在核糖核酸分子中改变基因信息的过程。曾经认为在人类和其他脊椎动物中很少有人认为,在人类基因组中,核糖核酸的编辑被公认为是广泛存在的。
研究结果发表于10月1日的<<肿瘤细胞在线版。
“这些结果强调核糖核酸编辑作为一个令人兴奋的主题,调查癌症机制,生物标志物和治疗,说:”韩亮,博士,副教授生物信息学和计算生物学。“在这项研究中,我们确定了一个明显的临床相关的编辑事件,其中许多是在非编码区。”
韩亮,博士
梁说,特定的RNA编辑过程,腺苷,肌苷(A-I),丰富的人类基因组中却没有得到过深入的研究。这项研究提供了新的细节,这一点小的生物现象,可能有显着的临床相关性。
“如果一种蛋白在肿瘤蛋白中的高度的编辑,而不是在正常蛋白中,那么它是可能的,一个特定的药物可以被设计来抑制编辑的突变蛋白,”梁。以往的研究都集中在基因突变,主要集中在正常组织中的核酸编辑。在人类癌症中的作用,在人类癌症中的作用仅仅是开始出现的个别病人的样本在一些癌症的早期研究。”
更大范围的癌症基因组图谱研究提供了改变蛋白质或核酸序列所需的信息,这可能是影响预后的生物标志物或治疗靶点的“驱动因素”。“核糖核酸编辑在探索中增加了另一层复杂性,以预测患者生存能力,并提出新的治疗方法,”。
MD安德森研究的参与者包括冷汉,博士,历下刁,博士,杨阳博士,袁博士,李军,博士和振林居,博士,所有的生物信息学和计算生物学;双兴玉,M.D.,街里,卡琳娜已经认识到,博士,丽迪雅先生,博士,康晋郑某,博士,夷陵路,医学博士戈登米尔斯,医学博士,博士,系统生物学;杰森roszik,博士和史葛博士,博士,樵夫,黑色素瘤肿瘤医学。
其他参与机构包括中国医科大学、中国沈阳市;斯坦福大学,斯坦福,加利福尼亚州;休斯敦公共卫生学院德克萨斯大学健康科学中心;Haukeland大学医院,卑尔根,挪威;贝勒医学院,休斯敦;和中山大学,广州,中国。
这项研究是由美国国立卫生研究院资助的(ca168394,ca098258,u24ca143883,r01ca175486,ca016672和r01gm102484),德克萨斯癌症预防研究所(rp140462),珍妮·谢尔比奖学金基金,洛林戴尔计划在生物信息学对癌症药物的个性化,阿德尔森医学研究基金会,和阿斯利康。
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