胰腺癌细胞内传播的肿瘤基因数据包

MD安德森科学家从外来做肿瘤全基因组的下一代分析

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MD安德森新闻稿12 \/ 17 \/ 2015

胰腺癌肿瘤分子秘密泄漏进入血流，脱落的完整的DNA和RNA包裹在保护脂质颗粒，使他们成熟的分析与液体活检，在肿瘤学年鉴德克萨斯大学MD Anderson癌症中心的研究人员报告在线。

该研究团队进行了全基因组，用内外来血液或其他液体的生物样本中发现三例患者循环DNA和RNA的全外显子组和肿瘤的基因表达分析。

anirban Maitra，m.b.b.s.

“Analysis of exosomal DNA and RNA allows us to do everything you can do off a direct biopsy of tumor tissue,” said senior author anirban Maitra，m.b.b.s.,  professor of Pathology and director of  MD Anderson’s Sheikh Ahmed Bin Zayed Al Nahyan Center for Pancreatic Cancer Research.

这项研究是MD安德森登月计划加快临床和预防的进展，从科学知识的发展下进行。Maitra共同领导的胰腺癌登月，计划中的12个。

原则性研究的证明打开了验证研究的大门，在多个肿瘤类型的液体活检，可以用来确定预后，指导有针对性的治疗和监测治疗。

胰腺活检挑战

Maitra和同事检测了多种肿瘤衍生的生物标志物，包括基因突变、插入、删除、拷贝数的分布和基因融合，可以作为新抗原的免疫系统–新目标。潜在的可治疗的突变，包括BRCA2和Notch1、鉴定。

“一个全面的液体活检会遇到一个描述胰腺癌和其他癌症在身体深处的重大挑战，“Maitra说。“这些肿瘤很难进入，即使是使用针或活检，因此获得足够的组织，使一个完整的下一代测序是困难的。”

正在开发的其他液体活检主要依靠血液循环中的游离DNA的发现。 保护血液的DNA是被酶，所以DNA允许一些基因组分析，Maitra说，但不是全基因组或全外显子测序。

无细胞核糖核酸在血液中更容易被破坏。 exosomes膜球，保护DNA和RNA的货物内部的破坏，保持高品质的样品。

基因表达分析

“完整的核糖核酸测序是很重要的，因为基因组测序告诉你哪些基因被改变，而分析核糖核酸告诉你什么异常基因实际上是被表达的，”他说。“棚外泌体允许我们做匹配的DNA和RNA的同时在液体活检在分辨率不适合在无细胞的方法。”

常见的临床实践现在呼吁只有前活检在肿瘤位置深 演示。在治疗过程中进行组织切片检查，更密切地监测治疗的成功或失败，并帮助研究人员更好地了解癌症基因组的发展如何应对治疗。

“肿瘤在治疗过程中不断发展。 新变化、新途径、新突变的出现，“Maitra说。付款人通常不包括多个活组织切片检查。“现在你可以绕过 组织的需要，获得完整的基因组，一小瓶血液基因组和转录组、“Maitra说。

外泌体实际上可能油漆更完整的肿瘤基因组多样性图片，因为所有的基因突变在原发性和转移性肿瘤会流入液体活检通过exosomes的研究人员指出。采样部分的肿瘤可能只捕获在该地区的突变，并没有反映其整体的基因组多样性。

外泌体2例患者从血液样本中分离并在患者胸腔积液患者肺转移。 全基因组测序已经覆盖了百分之91的人类基因组，基因组的蛋白编码基因测序只覆盖了95到百分之99。

在大样本的验证，更多的癌症

共同作者伊格纳西奥Wistuba，医学博士，转化的分子病理学的椅子，在MD安德森Maitra和其他研究人员致力于开发一种方法捕获外来的和验证的方法在其他的“内脏”（深部）的癌症。 

Maitra和Wistuba计划与其他癌症登月最初的工作，以开发用于临床质量协会范围内的液体活检的终极目标。

“我们将验证在一个更大的人口，我们的研究结果与患者的预后相关，“Wistuba说。“目前还没有临床应用，我们在早期的发展，但它是非常令人兴奋的。”

Maitra持有谢赫哈里发本扎耶德阿勒纳哈扬大学杰出的椅子。 年刊是欧洲肿瘤医学学会的官方刊物。

共同作者Maitra和Wistuba合作第一作者弗兰西斯圣卢卡斯，博士，转化分子病理学；开尔文艾伦森，医学博士，肿瘤外科；和Vincent伯纳德，病理学，他也是在生物医学科学的德克萨斯大学研究生院的研究生，由安德森和休斯敦德克萨斯大学健康科学中心联合操作；和赫阿尔瓦雷斯，医学博士，博士，谁是在胰腺癌研究中心和出版的共同高级作者的液体活检平台科学管理。 其他共同作者包括乔纳森卡斯蒂略，博士，东基姆，医学博士，和克里斯汀埃利斯病理学；李东辉，博士， 罗伯特沃尔夫，医学博士，和Gauri varadhachary，医学博士，m.b.b.s， 胃肠肿瘤内科；马修卡茨，肿瘤外科医学博士Eric ehli，博士， 加里斯戴维斯博士和杰森彼得森博士，  ，为人类遗传学，该院苏福尔斯，南达科他

这项研究是由MD Anderson的胰腺癌的登月计划的资助，谢赫艾哈迈德胰腺癌研究中心，从国家卫生研究院国家癌症研究所资助（5t32ca009599-27，r01ca113669，u01ca196403，u01dk108328，p30ca016672），MD Anderson癌症中心资助（ca16672）的高分辨率电子显微镜设备，翻译的分子病理学奖学金在MD安德森；和德克萨斯癌症预防研究所。

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